Germanie oraz Słowianie praktykowali kulty religijne zgodne z naturą. Wierzyli w wielu bogów. Wraz z podbojem tych ziem w 1200 roku na te tereny wkracza chrześcijaństwo. W 1549 roku kościół ewangelicko-luterański wyparł w Meklemburgii rzymskokatolicki. W późniejszym okresie pojawiły się także wyznania kalwinistyczne i pietystyczne, a w XVIII na niektóre obszary powrócił katolicyzm. W miastach istniały gminy żydowskie, z przerwami spowodowanymi prześladowaniami.
W 1919 roku Republika Weimarska zagwarantowała wolność wyznania. Trwało to do 1933 roku, od kiedy zaczęto podejrzliwie patrzeć na chrześcijan, a Żydów eksterminowano. Po 1945 roku SED ponownie bacznie śledził chrześcijan i utrudniał ich działalność. Rok 1990 przyniósł wolność wyznania, co doprowadziło w Meklemburgii-Pomorzu Przednim do powstania gmin żydowskich oraz po raz pierwszy muzułmańskich.